Las Águilas del América, Chivas del Guadalajara y Xoloitzcuintles de Tijuana si jugarán en la Copa MX - Clausura 2017 ya que no participaran en la Copa Libertadores de América por la salida de los clubes mexicanos del torneo continental que organiza CONMEBOL.
Al igual que para estos tres clubes se abren la oportunidad a los rayados del Monterrey de jugar en la Copa MX debido a que el conjunto regio montano quedó fuera de la siguiente ronda de la Liga de Campeones de CONCACAF.
Junto a estos equipos de abre el cupo para dos escuadras más, una del Ascenso MX y otra del máximo circuito para así completar nueve grupos de tres integrantes cada uno.
Éstos detalles se dieron a conocer en la Asamblea Ordinaria de la Liga MX por conducto de Enrique Bonilla.
